摘要： 廉价代码与正确代码并非一回事。AI生成的实现代码流利且快速，但自信地犯下易于忽视的错误。正确性：未经察觉的输出变更会污染所有后续分析。归属权：忽视原始贡献者的努力损害了激励结构。碎片化：不同行为表现导致用户难以信任。现有工具正确，且这种正确性来之不易。重写应承担三项责任：完全复现输出、准确标注引用来源、明确声明已验证和未验证的内容。
讨论： AI编程助手使领域专家能够快速重写现有科学软件。我们相信生物信息学领域将迎来AI驱动的工具重写浪潮，并已发布最佳实践原则以指导正确的方法。在此过程中，我们完全重写了并开源了RNA-seq基因组QC工具（最广泛使用的基因组流水线），性能提升超过60倍。社区反馈积极，特别关注验证和兼容性，认为这将大幅减少RNA-seq QC的运行负担。
原文标题：Rewrites.bio: 60x speedup in Genomics QC and AI rewrite principles for Science
原文链接：https://rewrites.bio/
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